Diferencia entre proteómica y transcriptómica
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los diferencia principal entre proteómica y transcriptómica es que la La proteómica es el estudio de todo el conjunto de proteínas producidas por un organismo en particular, mientras que la transcriptómica es el estudio de todo el conjunto de ARNm sintetizado por un organismo en particular..
La proteómica y la transcriptómica son dos áreas en las que se estudia la expresión génica de un organismo en particular.
Áreas clave cubiertas
1. ¿Qué es la proteómica?
- Definición, Hechos, Aplicaciones.
2. ¿Qué es la transcriptómica?
- Definición, Hechos, Aplicaciones.
3. Cuáles son las similitudes entre la proteómica y la transcriptómica
- Esquema de características comunes
4. ¿Cuál es la diferencia entre proteómica y transcriptómica?
- Comparación de diferencias clave
Términos clave
Aplicaciones, ARNm, Proteínas, Proteómica, Técnicas, Transcriptómica.
¿Qué es la proteómica?
La proteómica es el estudio a gran escala de los proteomas. El proteoma se refiere al conjunto completo de proteínas producidas por un organismo particular o una célula. Por lo tanto, un tipo particular de organismo o célula tiene un proteoma único. Las principales áreas de investigación de la proteómica son las siguientes..
- Predicción de la estructura 3D de una proteína;
- Detección de la localización y el tiempo de la síntesis proteica;
- Las tasas de producción de proteínas, degradación y abundancia en estado estacionario;
- Modificaciones de proteínas tales como modificaciones postraduccionales;
- Transporte de proteínas entre compartimentos subcelulares;
- Participación de proteínas en vías metabólicas;
- Interacción de proteínas entre sí..
Figura 1: Ejemplos de estructuras de proteínas disponibles en el PDB
Varias tecnologías de alto rendimiento, como la espectroscopia de masas y la diferencia en la electroforesis en gel (DIGE), están involucradas en los estudios proteómicos..
¿Qué es la transcriptómica?
La transcriptómica es el estudio del transcriptoma de un organismo o célula en particular. Transcriptome se refiere a todo el conjunto de ARNm en el organismo o la célula. Sin embargo, a veces también se refiere a todo el conjunto de ARN. El transcriptoma varía con las condiciones ambientales a las que se enfrenta el organismo o la célula. Por lo tanto, refleja el conjunto de ARN expresado en un tiempo definido bajo un conjunto dado de condiciones. Transcriptomics incluye la investigación de los perfiles de expresión y el análisis de variantes de corte. Los microarrays de ADN y el RNA Seq son las dos tecnologías principales utilizadas en la transcriptómica..
Figura 2: Microarrays y RNA Seq.
Similitudes entre proteómica y transcriptómica
- La proteómica y la transcriptómica son dos tipos de campos que estudian la expresión génica de un organismo particular o un tipo de células.
- Las técnicas de alto rendimiento se utilizan tanto en proteómica como en transcriptómica..
Diferencia entre proteómica y transcriptómica
Definición
La proteómica se refiere al estudio de los proteomas y sus funciones, mientras que la transcriptómica se refiere al estudio de los transcriptomas y sus funciones..
Tipo de estudio
La proteómica estudia todo el conjunto de proteínas expresadas, mientras que la transcriptómica estudia el conjunto completo de ARNm expresado en un organismo particular.
Fenómenos
La proteómica estudia la estructura y función 3D de las proteínas y las interacciones proteína-proteína, mientras que la transcriptómica estudia la estructura de la secuencia, las interacciones con el entorno y las aplicaciones del ARNm..
Tecnicas
La proteómica implica espectroscopia de masas y electroforesis en gel de diferencia (DIGE), mientras que la transcriptómica implica microarrays de ADN y secuencias de ARN como técnicas.
Áreas importantes
Algunas de las áreas importantes de la proteómica son los desarrollos de la base de datos del proteoma, como SWISS-2DPAGE y el desarrollo de software para el diseño de medicamentos asistidos por computadora, mientras que la transcriptómica implica el estudio de la diferenciación celular, la carcinogénesis, los mecanismos moleculares y las vías de señalización, que controlan el desarrollo embrionario temprano, como biomarcadores para la evaluación de riesgos de fármacos o productos químicos, y para inferir relaciones filogenéticas entre individuos.
Conclusión
La proteómica es el estudio de todo el conjunto de proteínas de un organismo particular, mientras que la transcriptómica es el estudio de todo el conjunto de ARNm del organismo. Por lo tanto, la principal diferencia entre proteómica y transcriptómica es el tipo de estudio..
Referencia:
1. “¿Qué es la proteómica?” Proteómica: una introducción a los recursos de EMBL-EBI, 8 de junio de 2016, disponible aquí
2. Lowe, Rohan et al. "Transcriptomics Technologies". PLoS Computational Biology 13.5 (2017): e1005457. PMC. Web. 10 de julio de 2018, disponible aquí.
Imagen de cortesía:
1. “Ejemplos de estructura de proteínas” por Axel Griewel - Trabajo propio (CC BY-SA 3.0) a través de Commons Wikimedia
2. “Celda de flujo de microarrays y secuenciación” por Thomas Shafee - Trabajo propio (CC BY 4.0) a través de Commons Wikimedia
