Diferencia entre el exoma y el transcriptoma
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los diferencia principal entre exoma y transcriptoma es que la El exoma es la secuencia completa de todos los exones en los genes codificadores de proteínas en el genoma, mientras que el transcriptoma es la colección de moléculas de ARN mensajero derivadas de los genes codificadores de proteínas.. Además, el exoma cubre el 1-2% de la secuencia total del genoma, mientras que el transcriptoma representa menos del 4% del ARN total de la célula..
Exome y transcriptome son dos colecciones de secuencias en genes codificantes de proteínas en el genoma. Ambos tienen diversas aplicaciones tanto en estudios genómicos como en el diagnóstico de enfermedades..
Áreas clave cubiertas
1. Que es el exoma
- Definición, Hechos, Técnicas.
2. Que es Transcriptome
- Definición, Hechos, Técnicas.
3. ¿Cuáles son las similitudes entre el exoma y el transcriptoma?
- Esquema de características comunes
4. ¿Cuál es la diferencia entre el exoma y el transcriptoma?
- Comparación de diferencias clave
Términos clave
Exón, exoma, ARNm, genes codificantes de proteínas, transcriptoma
Que es el exoma
El exoma es la colección de exones en los genes codificadores de proteínas del genoma de un organismo en particular. La secuencia de codificación del genoma se agrupa en genes, que pueden codificarse para proteínas o ARN. En el genoma procariótico, la secuencia de codificación no se interrumpe por otras secuencias, mientras que en el genoma eucariótico, la secuencia de codificación del gen se interrumpe por secuencias no codificantes llamadas intrones. Por lo tanto, las secuencias de codificación agrupadas se llaman exones..
Figura 1: Exones e intrones
En los genes codificantes de proteínas, la ARN polimerasa transcribe los intrones y los exones en el ARNm precursor durante la transcripción. Los intrones incorporados se eliminan durante las siguientes modificaciones post-transcripcionales. La principal tecnología utilizada en el estudio del exoma es la secuenciación del exoma completo (WES). WES participa en la hibridación del ADN fragmentado de un genoma en particular para identificar las secuencias de ADN objetivo seguidas de la secuenciación.
Que es Transcriptome
Transcriptome es el conjunto total de ARNm expresados en una célula. Representa menos del 4% del ARN total de la célula. Dado que el transcriptoma especifica la composición del proteoma, determina la capacidad bioquímica de esa célula en particular. Además, el transcriptoma de una célula particular no se puede sintetizar y siempre llega a la célula hija desde la célula madre durante la división celular. Por lo tanto, la transcripción, que es el proceso de producción de ARN, es el paso para el mantenimiento del transcriptoma..
Figura 2: Transcriptoma de célula pluripotente
Por otro lado, aunque cada célula contiene información para la producción de todo el transcriptoma de la especie, los genes de expresión en la célula también dependen de los factores ambientales. Las dos tecnologías principales utilizadas en el estudio de los transcriptomas son microarrays y RNA-seq..
Similitudes entre el exoma y el transcriptoma
- Exome y transcriptome son dos conjuntos de secuencias de nucleótidos que se encuentran en el genoma.
- Ambos están asociados con la información en los genes codificadores de proteínas..
- Están compuestos de exones..
Diferencia entre el exoma y el transcriptoma
Definición
El exoma se refiere a la parte del genoma que consta de exones, que codifica la información para la síntesis de proteínas, mientras que el transcriptoma se refiere a la suma total de todas las moléculas de ARN mensajero expresadas en los genes de un organismo. La principal diferencia entre el exoma y el transcriptoma se explica por sí misma a partir de esta definición..
Significado
Por lo tanto, el exoma es el conjunto total de exones en los genes codificadores de proteínas, mientras que el transcriptoma es el conjunto total de ARNm expresados en la célula..
ADN o ARN
Además, el exoma se compone de ADN, mientras que el transcriptoma se compone de ARN.
Cantidad
El exoma representa el 1-2% del genoma total, mientras que el transcriptoma representa menos del 4% del ARN total de la célula.
Nivel
Otra diferencia entre el exoma y el transcriptoma es que el exoma está en el nivel genómico, mientras que el transcriptoma está en el nivel de transcripción.
Tecnicas
Además, la secuenciación de todo el exoma es la técnica para determinar el exoma, mientras que la micromatriz y la secuencia de ARN determinan el transcriptoma..
Conclusión
El exoma es el conjunto completo de exones en el genoma determinado por el WES del genoma. Por lo tanto, el exoma es un concepto basado en el ADN. Pero, el transcriptoma es un concepto basado en el ARN, ya que es el conjunto completo de ARNm de la célula. La principal diferencia entre exoma y transcriptoma es su concepto..
Referencia:
1. Warr, Amanda et al. “Secuenciación del exoma: perspectivas actuales y futuras”. G3: Genes | Genomes | Genetics 5.8 (2015): 1543-1550. PMC. Web. 6 de septiembre de 2018. Disponible aquí
2. Brown TA. Genomas 2ª edición. Oxford: Wiley-Liss; 2002. Capítulo 3, Transcriptomas y Proteomas. Disponible aquí
Imagen de cortesía:
1. “ADN exones intrones” por el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (Dominio Público) a través de Commons Wikimedia
2. "El transcriptoma de las células pluripotentes" Por Grskovic, M. y Ramalho-Santos, M., El transcriptoma pluripotente (10 de octubre de 2008), StemBook, ed. La comunidad de investigación de células madre, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Figura 2 El transcriptoma de las células pluripotentes.Grskovic, M. y Ramalho-Santos, M., El transcriptoma pluripotente (10 de octubre de 2008), StemBook, ed. La comunidad de investigación de células madre, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. (CC BY 3.0) a través de Commons Wikimedia
