Diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma

los diferencia clave entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma es que la secuencias de secuenciación del genoma completo el genoma completo de un organismo mientras que las secuencias de secuenciación del exoma solo el exoma o los genes codificantes de proteínas de un organismo.

La secuenciación es una técnica que determina el orden preciso de los nucleótidos en una molécula de ADN particular. Simplemente refleja el orden correcto de las cuatro bases; adenina (A), guanina (G), citosina (C) y timina (T) en un fragmento de ADN. Existen varios métodos de secuenciación, como la secuenciación de Sanger, la secuenciación de la próxima generación, etc. Además, o bien el genoma completo de un organismo (secuenciación del genoma completo) o solo los genes codificantes de proteínas en el genoma (secuenciación del exoma) pueden someterse a secuenciación.

CONTENIDO

1. Resumen y diferencia clave
2. ¿Qué es la secuenciación del genoma completo?
3. ¿Qué es la secuenciación del exoma?
4. Similitudes entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma
5. Comparación lado a lado: secuenciación del genoma completo frente a secuenciación del exoma en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es la secuenciación del genoma completo??

El genoma humano contiene casi tres mil millones de pares de bases de ADN. La secuenciación del genoma completo es un método que secuencia el genoma completo de un organismo. Por lo tanto, en la secuenciación del genoma completo, la consideración está en la colección completa de moléculas de ADN, incluidos los exomas, los intrones, los espacios intergénicos, etc..

Figura 01: Secuenciación del genoma completo

Al prepararse para esta secuenciación, el primer paso es extraer todo el ADN. Luego, el ADN extraído se somete al procedimiento de secuenciación utilizando un método de secuenciación adecuado. Al analizar las secuencias resultantes, utilizando una herramienta de bioinformática, podemos descubrir las enfermedades raras, el cáncer, las enfermedades infecciosas, etc..

¿Qué es la secuenciación del exoma??

El exoma es una parte del genoma que contiene aproximadamente el 1,5% del genoma, y ​​es la colección de exones. Los exones son las secuencias que se transcriben en ARNm y luego en el producto proteico final. Por lo tanto, secuencias de secuenciación del exoma las secuencias codificantes de proteínas completas en el genoma. La secuenciación del exoma revela los trastornos genéticos, ya que la mayoría de los trastornos genéticos surgen debido a las mutaciones de los genes codificadores de proteínas. Por lo tanto, los procesos de diagnóstico de trastornos genéticos utilizan frecuentemente la secuenciación del exoma como un método para diagnosticar la enfermedad. Además, cuando se compara con la aplicación de secuenciación del genoma completo para las pruebas genéticas, la secuenciación del exoma requiere menos tiempo y es menos costosa.

Figura 02: Secuenciación del exoma

En la secuenciación del exoma, primero, es necesario seleccionar solo las secuencias codificantes de proteínas del ADN total. Tenga en cuenta que los humanos tienen alrededor de 180000 secuencias codificantes de proteínas. Luego, el exoma se secuencia utilizando un método de secuenciación de alto rendimiento..

¿Cuáles son las similitudes entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma??

• La secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma son dos aplicaciones de la secuenciación.
• Ambos métodos son útiles para determinar el orden correcto de la secuencia de nucleótidos en ambos métodos.
• Además, la bioinformática ayuda en ambas técnicas a analizar datos..

¿Cuál es la diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma??

Secuencias de secuenciación del genoma completo el ADN completo del genoma de un organismo, mientras que las secuencias de secuenciación del exoma solo las secuencias codificantes de proteínas del genoma. Por lo tanto, esta es la diferencia fundamental entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma. Además, aunque ambos métodos se utilizan ampliamente para determinar el orden correcto de la secuencia de nucleótidos, la secuenciación del genoma completo es costosa y requiere mucho tiempo que la secuenciación del exoma.

La siguiente infografía tabula la diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma.

Resumen - Secuenciación del genoma completo frente a la secuenciación del exoma

La secuenciación revela el orden preciso de las bases en un fragmento de ADN y puede ser la secuenciación del genoma completo o la secuenciación del exoma. Aquí, la secuenciación del genoma completo secuencia el genoma completo de un organismo, mientras que la secuenciación del exoma secuencia solo las secuencias codificantes de proteínas en el genoma. Teniendo en cuenta sus aplicaciones, la secuenciación del genoma completo es útil para analizar las aberraciones genéticas, como las variaciones de un solo nucleótido, las deleciones, las inserciones, etc. en todo el genoma, mientras que la secuenciación del exoma es útil para detectar enfermedades genéticas. Por lo tanto, esta es la diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma.

Referencia:

1. “Paneles de secuenciación de genoma completo frente a exoma completo frente a paneles de secuenciación dirigida”. Healio, SLACK Incorporated. Disponible aquí  
2. “¿Qué son la secuenciación completa del exoma y la secuenciación del genoma completo? - Genetics Home Reference - NIH. ”Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU., Institutos Nacionales de la Salud. Disponible aquí  

Imagen de cortesía:

1. "Secuenciación de escopeta de genoma completo versus secuenciación de escopeta jerárquica" Por Commins, J., Toft, C., Fares, M. A. "Métodos de biología computacional y su aplicación a la genómica comparativa de bacterias simbióticas endocelulares de insectos". (CC BY-SA 2.5) vía Commons Wikimedia  
2. "Exome Sequencing Workflow 1a" Por SarahKusala - Trabajo propio, (CC BY 3.0) vía Commons Wikimedia