Diferencia entre la página SDS y la página nativa

Diferencia Clave - Página SDS vs Nativo Página
 

SDS y la página nativa son dos tipos de técnicas de electroforesis en gel de poliacrilamida utilizadas en biología molecular. los diferencia clave Entre SDS Page y Native Page es el tipo de gel de poliacrilamida utilizado.. En la página SDS se usa un gel desnaturalizante, por lo tanto, las moléculas se separan según su peso molecular. Por el contrario, en Native Page, se utilizan geles no desnaturalizantes.. Por lo tanto, las moléculas se separan en función de su tamaño, carga y forma..

Electroforesis en gel de poliacrilamida (Page) utiliza un gel fabricado mediante la polimerización de monómeros de acrilamida con metileno bisacrilamida. La poliacrilamida es más resistente y más estable al calor que la agarosa. Los geles de poliacrilamida tienen un tamaño de poro más pequeño que permite la separación eficiente de proteínas. Hay dos tipos principales de configuraciones de página: la página SDS y la página nativa. Página SDS o Electroforesis en gel de poliacrilamida con sulfato de sodio y dodecilo Separa las proteínas en función de sus pesos moleculares. Los geles desnaturalizantes se utilizan en la página SDS. Native Page utiliza geles no desnaturalizantes y separa las proteínas según su tamaño, carga y forma (conformación 3D).

CONTENIDO

1. Resumen y diferencia clave
2. ¿Qué es la página de SDS?
3. ¿Qué es la página nativa?
4. Similitudes entre la página de SDS y la página nativa
5. Comparación lado a lado: página SDS vs página nativa en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es la página de SDS??

SDS Page es la técnica electroforética más común utilizada para separar proteínas en función de su peso molecular. El gel se fabrica agregando SDS (dodecil sulfato de sodio), que es un detergente. SDS dentaduras de proteínas en monómeros. SDS es un detergente aniónico. Por lo tanto, agrega una carga neta negativa a las proteínas dentro de un amplio rango de pH. Cuando la carga negativa neta se imparte a las moléculas de proteína, debido a la variación de la carga, las estructuras complejas se descomponen. Debido a la carga negativa, las proteínas se atraen hacia el final positivo. Así, las moléculas con menor peso molecular viajan más rápido en la matriz del gel y pueden observarse cerca del ánodo, mientras que las proteínas de mayor peso molecular se observan más cerca de los pozos.

Figura 01: Página SDS

La unión de SDS a la cadena polipeptídica es proporcional a su masa molecular relativa. Por lo tanto, la masa molecular también se puede determinar a través de la página SDS. La tinción de los geles SDS Page se realiza mediante tinción con azul de bromofenol. Las aplicaciones del rango de páginas de SDS en una mayor extensión pueden usarse para estimar la masa molecular relativa y para determinar la abundancia relativa de proteínas en una mezcla de proteínas. SDS Page también se puede usar para determinar la distribución de proteínas en una mezcla de proteínas. SDS Page también se aplica para purificar y evaluar proteínas. Se utiliza como un procedimiento preliminar para la transferencia de Western e hibridación, que a su vez se utiliza para el mapeo de proteínas y la identificación.

¿Qué es la página nativa??

La electroforesis en gel de poliacrilamida nativa (Native Page) utiliza un gel no desnaturalizante. Por lo tanto, SDS o cualquier otro agente desnaturalizante no se agrega a la matriz del gel. En Native Page, la separación de proteínas se basa en la carga y el tamaño de la proteína. Por lo tanto, la movilidad de la proteína depende de la carga y el tamaño de la proteína..

La carga de la proteína depende de las cadenas laterales de los aminoácidos. Si las cadenas laterales están cargadas negativamente, la proteína recibirá una carga negativa general y viceversa. Las proteínas conservan una conformación 3D debido al plegamiento que tiene lugar. El plegamiento resulta de los diversos tipos de enlaces en proteínas tales como enlaces disulfuro, interacciones hidrófobas y enlaces de hidrógeno. Por lo tanto, si la página nativa se lleva a un pH neutro, las proteínas se separarán de acuerdo con la forma molecular de la proteína. Por lo tanto, Native Page se puede usar como una técnica sensible para detectar el cambio en la carga o la conformación de la proteína.

La principal ventaja de la página nativa es que la proteína utilizada para el análisis de la página se puede recuperar en su estado original después del análisis de la página, ya que la proteína no se altera durante el proceso. La página nativa es una técnica de rendimiento relativamente alto y la estabilidad de la proteína aumenta..

Figura 02: Página nativa

Una vez finalizada la ejecución del gel, se puede ver el gel Native Page mediante tinción con azul de bromofenol o cualquier otro reactivo de tinción adecuado. Las aplicaciones de Native Page incluyen la separación de proteínas ácidas que incluyen glicoproteínas como la eritropoyetina recombinante humana o la identificación de proteínas presentes en la albúmina de suero bovino (BSA).

Cuáles son las similitudes entre la página de SDS y la página nativa?

  • Los sistemas SDS Page y Native Page utilizan gel de poliacrilamida como matriz del gel..
  • Ambos se utilizan para la separación e identificación de proteínas..
  • Ambos utilizan movilidad electroforética para separar los compuestos..
  • Ambos se pueden hacer de manera vertical u horizontal (en su mayoría se realizan como configuraciones de página verticales porque la longitud de ejecución es mayor).
  • El aparato de electroforesis que incluye el tanque de gel, los peines y la fuente de alimentación es necesario para el funcionamiento de ambas técnicas..
  • La visualización del gel se puede realizar mediante métodos de tinción en ambas técnicas..

¿Cuál es la diferencia entre la página de SDS y la página nativa??

Página SDS vs Página nativa

SDS Page o Sodium-dodecyl sulfate Page separa las proteínas según su peso molecular y utiliza un gel desnaturalizante. Native Page utiliza geles no desnaturalizantes y separa las proteínas según su tamaño, carga y forma (conformación 3D).
 Tipo de gel
Se utiliza un gel desnaturalizante en la página SDS.. En la página nativa se utiliza un gel no desnaturalizante..
Presencia de SDS
SDS está presente como un detergente para impartir una carga negativa en la muestra en la página SDS. SDS no está presente en la página nativa.
 Base de separación 
La separación de proteínas depende del peso molecular de la proteína en la página de SDS. La separación depende del tamaño y la forma de la molécula de proteína en la página nativa.
Estabilidad de la proteína
La estabilidad de la proteína es baja en la página de SDS.. La estabilidad de la proteína es alta en la página nativa..
Recuperación de la proteína original
No es posible ya que está desnaturalizado en la página de SDS.. Posible en la página nativa..

Resumen - Página SDS vs Nativo Página

SDS Page y Native Page son dos tipos de técnicas de electroforesis en gel de poliacrilamida utilizadas para separar proteínas. La página de SDS se trata con un detergente llamado SDS. SDS imparte una carga negativa general a la proteína, que luego da como resultado la desnaturalización de la proteína. Por lo tanto, las proteínas se separan en función de su peso molecular. En contraste, la técnica Native Page no utiliza ningún agente desnaturalizante. Por lo tanto, las proteínas se separan según su tamaño o la forma. Esta es la diferencia entre la página de SDS y la página nativa.

Referencia:

1. “Principio y método de electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE)”. Principio y método de electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) | MBL Life Sience -ASIA-. Disponible aquí
2. "Geles nativos". Laboratorios de proteínas de la Alianza | Servicios de caracterización biofísica. Disponible aquí  

Imagen de cortesía:

1. SDS-PAGE Electrophoresis'By Bensaccount en Wikipedia en inglés, (CC BY 3.0) vía Commons Wikimedia  
2. 'Cargar una muestra en un pozo de electroforesis en gel de poliacrilamida' Por Blaz Nemec de Ljubljana, Eslovenia (CC BY-SA 2.0) a través de Commons Wikimedia