Diferencia entre Gene Knockout y Knockdown

los diferencia clave entre el gen knockout y el knockdown es que el El gen knockout es una técnica en la que el gen de interés se elimina por completo (estado inoperante) para estudiar las funciones del gen mientras La eliminación de genes es otra técnica en la que se silencia el gen de interés. Investigar el papel del gen particular en un sistema biológico..

Se están utilizando diferentes técnicas genéticas para investigar el funcionamiento de los genes dentro de los sistemas biológicos vivos. El knockout genético y el knockdown son dos de estas técnicas. Estas técnicas ayudan a los científicos a identificar aspectos funcionales de diferentes genes en organismos vivos..

CONTENIDO

1. Resumen y diferencia clave
2. Qué es Gene Knockout
3. ¿Qué es Gene Knockdown?
4. Similitudes entre Gene Knockout y Knockdown
5. Comparación lado a lado - Gen Knockout vs Knockdown en forma tabular
6. Resumen

Qué es Gene Knockout?

La desactivación de genes es una técnica genética que hace que uno o más genes no funcionen en los organismos vivos. Este es también un proceso para apagar o eliminar un gen de un organismo. La aplicación primaria de esta técnica es estudiar la función del gen. El proceso evalúa el efecto del gen perdido o eliminado. El proceso de eliminación directa también involucra ciertas enzimas y técnicas de empalme..

Figura 01: Gen Knockout

Existen pocas variaciones en la técnica de eliminación de genes en función del número de genes involucrados. Son doble nocaut (knockout de dos genes), nocaut triple (knockout de tres genes) y nocaut cuádruple (knockout de cuatro genes). El knockout genético se clasifica en dos grupos; nocauts heterocigotos y nocauts homocigotos.

¿Qué es Gene Knockdown??

La eliminación de genes es un procedimiento experimental en el que este procedimiento suprime o reduce la expresión de un gen o genes en particular de un organismo.. Silenciamiento genético Es la definición común para la eliminación de genes. Durante este procedimiento, la activación o la degradación del ARNm producido implica la interferencia de ARN (ARNi), el ARN de pequeña interferencia (ARNsi) y el ARN de horquilla corta (ARNhc)..

Figura 02: Silenciamiento de genes

El uso principal de la eliminación de genes es investigar el papel del gen en particular en el sistema biológico. Por lo tanto, esta técnica realiza el estudio de oncogenes (Bcl-2 y P53) y genes que causan enfermedades neurológicas, infecciones virales y enfermedades hereditarias..

¿Cuáles son las similitudes entre Gene Knockout y Knockdown??

• Tanto el knockout genético como el knockdown genético son técnicas genéticas.
• Estas dos técnicas pueden prevenir la expresión génica..
• El uso principal de ambas técnicas es investigar la función del gen de interés..
• Ambos son capaces de identificar diferentes enfermedades (genéticas)..
• Ambos podrían ser utilizados para uno o más genes de interés..

¿Cuál es la diferencia entre Gene Knockout y Knockdown??

Gene Knockout vs Knockdown
Knockout genético Es la operación de genes (eliminación de genes del ADN) de un organismo a través de diferentes técnicas genéticas..	Caída de genes es un procedimiento experimental para suprimir (reducir o silenciar) la expresión de un gen o genes en particular de un organismo.
Función
Facilita el estudio de las funciones de los genes mediante el análisis de los resultados del gen perdido..	Facilita el estudio de oncogenes, genes que causan enfermedades neurológicas, infecciones virales y enfermedades hereditarias..
Participación de agentes de ARN
La participación de los agentes de ARN es insignificante en esta técnica.	El proceso involucra a agentes tales como siRNA, shRNA y RNAi para desactivar el mRNA.
Uso de agentes químicos
Se utilizan agentes enzimáticos..	No se utilizan tales agentes químicos.
Efecto sobre el gen
Elimina completamente el gen del ADN..	Suprimir o silenciar el gen..
Clasificación
El knockout doble, el knockout triple y el knockout cuádruple y el knockout heterocigoto y homocigoto son diferentes tipos de knockout genético.	No hay sistemas de clasificación disponibles para el silenciamiento de genes..

Resumen - Gene Knockout vs Gene Knockdown

Las dos técnicas que discutimos aquí; Los genes knockout y knockdown, son métodos para investigar las funciones de diferentes genes. La desactivación del gen hace que el gen quede inoperante, mientras que la desactivación del gen silencia el gen de interés. Sin embargo, ambos procedimientos previenen la expresión génica. Diferentes agentes son capaces de cumplir estos dos procesos. La eliminación de genes es un tipo de eliminación, mientras que la eliminación de genes es un tipo de inactivación. Esta es la diferencia entre el gen knock out y knockdown.

Referencia:

1.Shaffer, Catherine. "Gene Knockout contra Knockdown". News-Medical.net, 12 de febrero de 2018. Disponible aquí  
2. "Gene Knockout". Nature News, Nature Publishing Group. Disponible aquí

Imagen de cortesía:

1. 'Knockout Mice5006-300' Por Maggie Bartlett, NHGRI. (Dominio público) a través de Commons Wikimedia 
2. 'ARNi-simplificado' Por Matzke MA, Matzke AJM (2004) Plantando las semillas de un nuevo paradigma. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC POR 2.5) vía Commons Wikimedia