Los términos gel de apilamiento y gel de separación se utilizan para explicar la técnica SDS-PAGE. La electroforesis en gel de SDS-PAGE o de dodecilsulfato de sodio y poliacrilamida es una técnica de laboratorio que se utiliza para separar las moléculas de proteínas en función de sus pesos moleculares. La teoría detrás de la técnica es que las proteínas con diferentes pesos moleculares muestran diferentes tasas de migración; las moléculas de bajo peso molecular migran más rápido, mientras que las moléculas de alto peso molecular migran lentamente. El medio para la migración es un gel. Hay dos tipos de geles nombrados como gel de apilamiento y gel de separación. los diferencia clave entre el gel de apilamiento y el gel de separación es que el pH del gel de apilamiento es 6.8 mientras que el pH del gel separador es 8.8.
1. Resumen y diferencia clave
2. ¿Qué es el gel de apilamiento?
3. Qué es el gel separador
4. Relación entre el gel de apilamiento y el gel de separación
5. Comparación lado a lado: gel de apilamiento frente a gel separador en forma tabular
6. Resumen
El gel de apilamiento es un gel de poliacrilamida de baja concentración que se coloca en la parte superior de un gel de resolución más concentrado (gel de separación) en la técnica SDS-PAGE. El gel de apilamiento se utiliza para mejorar la resolución de la electroforesis. La resolución aumenta debido a la diferencia entre las concentraciones de gel de apilamiento y el gel de resolución que afectan a las proteínas en la muestra. Dado que la concentración de poliacrilamida en el gel de apilamiento es baja, el tamaño de los poros es mayor. Esto también ayuda a aumentar la separación..
El gel de apilamiento es un gel de poliacrilamida suelto con poros grandes de aproximadamente 7% de poliacrilamida. Estos poros no actúan como una barrera considerable para las moléculas de proteínas grandes. Por lo tanto, este gel afecta ligeramente a la movilidad de esas proteínas. Esto hace que la separación de acuerdo con la movilidad y el tamaño de la proteína se concentre entre dos geles..
Figura 01: Gel de acrilamida SDS-PAGE
El pH del gel de apilamiento es de 6.8. Su pH es ácido que el del gel de resolución en 2 unidades de pH. Este pH implica una menor fuerza iónica por lo tanto una mayor resistencia eléctrica. Esto provoca la movilidad de las proteínas que otras partículas cargadas presentes en el gel..
El gel de separación o el gel de resolución de una técnica SDS-PAGE es un gel de poliacrilamida altamente concentrado que se coloca en la parte superior del gel de apilamiento de baja concentración. El gel de separación contiene una alta cantidad de poliacrilamida (10%). El pH de este gel se mantiene como pH = 8.8, que es un nivel de pH más alto que el del gel de apilamiento.
Figura 02: Aparato de electroforesis en gel.
Cuando las moléculas de proteína alcanzan el gel de separación, la migración de esas moléculas se ralentiza porque el gel de separación es un gel de alta concentración con un tamaño de poro pequeño que puede actuar como una barrera considerable para el movimiento de las moléculas de proteína. Esta ralentización permite que las otras proteínas emigren lentamente para ponerse al día, lo que resulta en una banda estrecha y concentrada entre los dos geles..
Gel Apilable vs Gel Separador | |
El gel de apilamiento es un gel de poliacrilamida de baja concentración que se coloca en la parte superior de un gel de resolución más concentrado (gel de separación) en la técnica SDS-PAGE.. | El gel de separación o el gel de resolución de una técnica de SDS-PAGE es un gel de poliacrilamida altamente concentrado que se coloca en la parte superior de un gel de apilamiento de baja concentración.. |
Colocación | |
El gel de apilamiento se coloca en el gel de resolución (separación). | El gel de separación se coloca en el fondo del recipiente utilizado para la electroforesis en gel.. |
Concentración | |
La concentración de gel de apilamiento es alta.. | La concentración de gel separador es baja.. |
Contenido de poliacrilamida | |
El gel de apilamiento contiene aproximadamente un 7% de poliacrilamida. | El gel de separación contiene aproximadamente un 10% de poliacrilamida. |
pH | |
El pH del gel de apilamiento es de 6.8.. | El pH del gel separador es de 8.8.. |
Tamaño de poro | |
Grandes tamaños de poros están presentes en el gel de apilamiento.. | Pequeños tamaños de poros están presentes en el gel de separación.. |
Resolución | |
Gel apilable da mejor resolución.. | Gel separador da una mala resolución.. |
El gel de apilamiento y el gel de separación son dos tipos de geles de poliacrilamida utilizados para obtener una mejor separación de las moléculas de proteína en una muestra determinada. La diferencia entre el gel de apilamiento y el gel de separación es que el pH del gel de apilamiento es de 6.8 mientras que el pH del gel de separación es de 8.8.
1. “Electroforesis en gel de poliacrilamida”. Electroforesis en gel de poliacrilamida (teoría): Laboratorio virtual de biología molecular II: Biotecnología e ingeniería biomédica: Laboratorio virtual Amrita Vishwa Vidyapeetham. Disponible aquí
2. "Cómo funciona SDS-PAGE". Bitesize Bio, 16 de febrero de 2018. Disponible aquí
3. "Gel de apilamiento SDS-PAGE - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew)." Google Sites. Disponible aquí
1. SDS-PAGE Acrylamide gel'By Bensaccount en Wikipedia en inglés, (CC BY 3.0) vía Commons Wikimedia
2. 'Aparato de electroforesis de gel' Por Jeffrey M. Vinocur - Trabajo propio, (CC-BY 2.5) vía Commons Wikimedia