Diferencia entre VNTR y STR

Diferencia principal - VNTR vs STR

El ADN repetitivo son los patrones de los ácidos nucleicos que se producen en múltiples copias en todo el genoma. Constituyen grandes proporciones del ADN nuclear en los eucariotas. Las repeticiones en tándem son uno de los principales tipos de ADN repetitivo que copian unidades de secuencias repetitivas adyacentes entre sí, formando un bloque de nucleótidos. VNTR (número variable de repeticiones en tándem) y STR (corta repetición en tándem) son dos tipos de repeticiones en tándem que se encuentran en el genoma eucariótico. VNTR es un tipo de ADN de minisatélite, mientras que STR es un tipo de ADN de microsatélite. los diferencia principal entre VNTR y STR es que la unidad repetitiva de VNTR es de 10 a 60 pares de bases, mientras que la unidad repetitiva de STR es de 2 a 6 pares de bases.

Áreas clave cubiertas

1. Qué es VNTR
     - Definición, características, importancia
2. Que es STR
     - Definición, Características, Importancia.
3. ¿Cuáles son las similitudes entre VNTR y STR?
     - Esquema de características comunes
4. ¿Cuál es la diferencia entre VNTR y STR?
     - Comparación de diferencias clave

Términos clave: Genética forense, Microsatélite, Minisatélite, Unidades de nucleótidos de repetición, STR, Repeticiones en tándem, VNTR

Qué es VNTR

VNTR se refiere a un tipo de repeticiones en tándem en las que una secuencia corta de nucleótidos (10-60 pares de bases) se repite un número variable de veces en un lugar particular. Por lo tanto, VNTR también se conoce como minisatélites. Los VNTR se intercalan en los cromosomas del genoma eucariota. Generalmente, el número de unidades repetidas en un VNTR varía entre individuos. Por lo tanto, la longitud de la matriz formada por VNTR también varía entre los individuos. Como el número variable de cromosomas se heredan de los padres, se pueden utilizar en la identificación paterna o personal. La variación de VNTRs en seis individuos se muestra en Figura 1.

Figura 1: Variación VNTR en individuos

Los VNTR son los primeros tipos de polimorfismos utilizados en el perfil del ADN para determinar las características del ADN de una persona en particular. También se utilizan como marcadores genéticos en RFLP (polimorfismo de longitud de fragmento de restricción), una técnica que utiliza PCR, electroforesis en gel y producción de patrones de banda por transferencia Southern. 

Que es STR

STR se refiere a un tipo de repeticiones en tándem en las que una secuencia corta de nucleótidos (2-6 pares de bases) se repite un número variable de veces en un locus particular. Los STR son un tipo de microsatélites y también se conocen como repeticiones de secuencia corta (SSR) en genética de plantas. Las unidades de repetición compuestas de un solo nucleótido se conocen como polimorfismo de un solo nucleótido (SNP). Los STR son el tipo más común de polimorfismos genéticos analizados actualmente en la genética forense. Los perfiles de ADN con el uso de STR como marcadores genéticos se muestran en Figura 2.

Figura 2: Perfiles de ADN

Las mutaciones en algunas de las regiones STR conducen a enfermedades genéticas como el síndrome X frágil y la enfermedad de Huntington.

Similitudes entre VNTR y STR

• VNTR y STR son dos tipos de repeticiones en tándem.
• Tanto VNTR como STR son regiones estructurales del genoma eucariota.
• Tanto VNTR como STR consisten en ADN no codificante.
• BothVNTR y STR son heredados de los padres.
• Tanto VNTR como STR se componen de secuencias repetitivas, dispuestas adyacentes entre sí en una matriz.
• Tanto VNTR como STR producen polimorfismo genético..
• Tanto VNTR como STR se extienden por todo el genoma..
• Tanto el VNTR como el STR se utilizan como marcadores genéticos en la genética forense.
• Las mutaciones en VNTR y STR conducen a enfermedades genéticas.

Diferencia entre VNTR y STR

Definición

VNTR: VNTR es un tipo de repetición en tándem en la que una secuencia corta de nucleótidos (10-60 pares de bases) se repite un número variable de veces en un locus particular.

STR: STR es un tipo de repetición en tándem en la que una secuencia corta de nucleótidos (2-6 pares de bases) se repite un número variable de veces en un locus particular.

Número de nucleótidos que se repiten 

VNTR: VNTR consiste en 10-60 pares de bases.

STR: STR consta de 2-6 pares de bases.

Tipo de ADN repetitivo

VNTR: VNTR es un tipo de ADN minisatélite..

STR: STR es un tipo de ADN microsatélite..

Número de repeticiones

VNTR: VNTR consiste en 10-1,500 repeticiones en la matriz.

STR: STR consta de 5-200 repeticiones en el array..

Tamaño de la matriz

VNTR: VNTR forma una matriz de 0.5-15 kb.

STR: STR forma una matriz de 10-1000 pb.

Complejidad de la matriz

VNTR: VNTR produce matrices heterogéneas.

STR: STR produce matrices homogéneas.

Conclusión

VNTR y STR son dos tipos de repeticiones en tándem que forman matrices de unidades repetitivas adyacentes en el genoma eucariótico. VNTR consiste en comparativamente una larga unidad repetitiva de nucleótidos (10-60 pares de bases). STR consiste en unidades de nucleótidos que se repiten en corto (2-6 pb). La principal diferencia entre VNTR y STR es la longitud de las unidades de repetición de cada tipo de repeticiones en tándem.

Referencia:

1. "Número variable de repetición en tándem". Temas de ScienceDirect, disponibles aquí.
2. “La ciencia de la genética forense”. CRG - Consejo para la Genética Responsable, disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "D1S80Demo" Por PaleWhaleGail en la Wikipedia en inglés (CC BY-SA 3.0) a través de Commons Wikimedia
2. “Etapas de la identificación genética” por Sneptunebear16 - Trabajo propio (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia