Diferencia entre benzonase y DNasa

Diferencia clave - Benzonase vs DNasa
 

La degradación de los ácidos nucleicos es importante para muchas técnicas de biología molecular. Es ampliamente utilizado en tecnología de ADN recombinante para deshacerse de fragmentos no deseados de ADN y ARN. Las enzimas que degradan el ácido nucleico se denominan Nucleasas y pueden ser de diferentes tipos según la función requerida. Las nucleasas que degradan el ADN se conocen como ADNas, mientras que las que degradan el ARN son RNasas conocidas. Estas enzimas se utilizan principalmente en in vitro experimentos donde en vitro Se realizan pruebas moleculares para aislar ADN puro, ARN o proteínas.. Las benzonasas son un tipo de nucleasas que degradan el ADN y el ARN, mientras que las ADNas solo degradan el ADN.. Esta es la diferencia clave entre Benzonase y DNase.

CONTENIDO

1. Resumen y diferencia clave
2. ¿Qué es Benzonase?
3. ¿Qué es la DNasa?
4. Similitudes entre benzonase y DNase
5. Comparación lado a lado - Benzonase vs DNase en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es Benzonase??

Benzonase es una endonucleasa genéticamente modificada de Serratia marcescens. Esta enzima se produce en E. coli Hosts en escala industrial. Benzonase es capaz de dividir ADN bicatenario, ADN lineal, ADN circular y ARN monocatenario. Así Benzonase es comercialmente importante. La enzima benzonase es un dímero proteico que tiene 245 aminoácidos idénticos, subunidades de ~ 30 kDa con dos enlaces disulfuro esenciales. La benzonasa escinde los ácidos nucleicos en su extremo 5 'y da como resultado fragmentos con los extremos 5' libres. Benzonase puede escindir los ácidos nucleicos en cualquier secuencia pero prefiere las regiones ricas en GC.

Benzonase se almacena a -20 ⁰C. El pH óptimo para la actividad de la enzima se encuentra entre 8,0 y 9,2. Las aplicaciones de Benzonase incluyen la preparación de muestras para electroforesis en gel de proteína 2D donde Benzonase elimina los ácidos nucleicos unidos y la eliminación de contaminantes de ácidos nucleicos de las preparaciones de proteínas recombinantes. También se utiliza para reducir la viscosidad de los extractos de proteínas y evitar la acumulación de células en una mezcla celular.

¿Qué es la DNasa??

La DNasa es una nucleasa, enzima hidrolítica que solo es capaz de dividir el ADN de doble cadena. Hay dos tipos principales de ADNasas: ADNasa I y ADNasa II. La ADNasa I participa en la escisión del ADN de doble cadena para producir polinucleótidos con extremos libres 5 '. La ADNasa II participa en la escisión del ADN de doble cadena para producir cadenas de polinucleótidos con extremos libres o voladizos de 3 '.

DNase I

La ADNasa I funciona a un pH óptimo entre 7,0 y 8,0. La actividad de la enzima depende de muchos cofactores iónicos que incluyen, Ca²⁺, Mg²⁺ o Mn²⁺. La actividad de Mg²⁺ y Mn²⁺ Decide la función de la DNasa I. En presencia de Mg.²⁺, La DNasa I divide cada hebra de ADNds independientemente. Esto se lleva a cabo de manera aleatoria. Por el contrario, en presencia de Mn.^2+, la enzima corta ambas cadenas de ADN en aproximadamente el mismo sitio. Esta división resultará en la producción de dos tipos de fragmentos de ADN; un tipo con extremos romos y otro tipo con uno o dos voladizos de nucleótidos.

Figura 02: DNasa

DNase II

La ADNasa II funciona a un pH óptimo de 4.5-5.0 y se requieren iones metálicos divalentes para su actividad, similar a la ADNasa I. Se sabe que el mecanismo de la ADNasa II consiste en tres pasos principales.

1. Se inducen múltiples roturas de una sola hebra dentro de la columna vertebral del ADN.
2. Se producen nucleótidos y oligonucleótidos solubles en ácido..
3. El cambio hipercrómico no lineal ocurre en la última fase..

Los principales inhibidores de la enzima ADNasa incluyen quelantes de metales, metales de transición y sustancias químicas como el dodecilsulfato de sodio y el β - mercaptoetanol..

Las aplicaciones principales de la DNasa incluyen la preparación de extractos de ARN libres de ADN y extractos de proteínas, y la eliminación de ADN plantilla durante los experimentos de transcripción in vitro..

¿Cuáles son las similitudes entre benzonase y DNase??

• Ambas son enzimas hidrolíticas.
• Ambas son nucleasas.
• Ambos participan mediante la escisión de los enlaces fosfodiéster de los ácidos nucleicos..
• Ambos requieren un pH óptimo y temperaturas de almacenamiento para mantener la actividad de la enzima.
• Los inhibidores de las enzimas incluyen agentes quelantes, metales de transición y productos químicos detergentes.
• Las aplicaciones se centran principalmente en la obtención de extractos de ADN, ARN y proteínas de alta pureza..
• Ambas enzimas pueden producirse mediante ingeniería genética.

¿Cuál es la diferencia entre benzonase y DNase??

Benzonase vs DNase
Benzonase es una enzima que es capaz de dividir el ADN de doble cadena, el ADN lineal, el ADN circular y el ARN..	La DNasa es una enzima que es capaz de dividir el ADN de doble cadena..
Sustrato para la enzima
Tanto el ADN como el ARN son sustratos para la benzonasa..	El ADN es el sustrato para la ADNasa..
Estructura
El rango de pH óptimo de Benzonase es 7.0 -8.0	Los rangos óptimos de pH de la ADNasa I son 7.0 - 8.0 y la ADNasa II es 4.5 - 5.0.

Resumen - Benzonase vs DNase

Las enzimas nucleasas se usan ampliamente en diferentes procedimientos experimentales con respecto a la biología molecular y la ingeniería genética. Benzonase y DNase son dos tipos de nucleasas. La benzonasa participa en la degradación del ADN y el ARN, mientras que la ADNasa participa en la división del ADN de doble cadena. Esta es la diferencia básica entre benzonase y DNase. En la actualidad, estos dos tipos de nucleasas se producen mediante tecnología de ADN recombinante que produce enzimas de mayor calidad que están optimizadas para una producción máxima..

Descargar la versión PDF de Benzonase vs DNase

Puede descargar la versión en PDF de este artículo y usarla para fines fuera de línea, como se indica en la nota de cita. Por favor descargue la versión PDF aquí Diferencia entre Benzonase y DNase

Referencias:

1. “Desoxirribonucleasa I del páncreas bovino D5025”. Sigma-Aldrich, Disponible aquí. Consultado el 19 de septiembre de 2017.
2. “Deoxirribonucleasa II”. Deoxiribonucleasa II - Manual de enzimas Worthington, Disponible aquí. Consultado el 19 de septiembre de 2017.

Imagen de cortesía:

1. "Sitio de hipersensibilidad de ADNsa" Por Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. - Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, y otros. (2012) Correlación entre la distribución de sitios hipersensibles a la ADNasa I y la expresión génica en células HeLa S3. PLoS ONE 7 (8): e42414. doi: 10.1371 / journal.pone.0042414 (CC BY-SA 2.5) vía Commons Wikimedia