Diferencia entre genotipado y secuenciación

Diferencia clave - Genotipado vs secuenciación
 

La genotipificación y la secuenciación son dos técnicas realizadas para obtener información sobre los ácidos nucleicos, principalmente el ADN de un organismo. La diferencia clave entre el genotipado y la secuenciación es que el genotipado es el proceso de determinar qué variante genética posee el individuo usando marcadores, mientras que la secuenciación es la determinación del orden correcto de la secuencia de nucleótidos dentro del fragmento de ADN dado.

CONTENIDO
1. Resumen y diferencia clave
2. ¿Qué es el genotipado?
3. ¿Qué es la secuenciación?
4. Comparación lado a lado - Genotipado vs secuenciación
5. Resumen

¿Qué es el genotipado??

El genotipado es la determinación de la composición genética de un individuo mediante una secuencia de ADN y marcadores y la comparación e identificación de su herencia. La genotipificación es importante en biología evolutiva, biología de poblaciones, taxonomía, ecología y genética de los organismos. Se puede realizar mediante diferentes técnicas que incluyen secuenciación de ADN, reacción en cadena de la polimerasa, polimorfismo de longitud de fragmento de restricción (RFLP), detección polimórfica amplificada al azar, polimorfismo de longitud de fragmento amplificada (AFLP), micromatrices de ADN, etc..

La genotipificación implica la secuenciación de pequeños fragmentos particulares de secuencias de ADN y el descubrimiento de la relación de la composición genética con otros individuos mediante marcadores genéticos. Determina los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) entre los individuos o los alelos específicos. La genotipificación es aplicable a una amplia gama de organismos, incluidos los humanos. También es aplicable a microorganismos como virus, hongos, etc. y se puede utilizar para determinar sus variantes genéticas con los perfiles de referencia. En epidemiología molecular y microbiología forense, el control de patógenos, especialmente microorganismos, se realiza mediante la información obtenida de la genotipificación. La genotipificación es muy importante en el análisis de pedigrí. Los seres humanos son genotipados para confirmar la maternidad y la paternidad. El genotipo revelará los alelos dominantes y recesivos de los genes que deciden rasgos específicos.

Figura_1: Genotipado RFLP

¿Qué es la secuenciación??

La secuenciación es el proceso de determinar el orden correcto del nucleótido en un fragmento dado de ADN o ARN. Prácticamente toda la información requerida para el crecimiento y desarrollo de un organismo está codificada en su genoma. La disponibilidad de técnicas para producir y separar unos pocos cientos de nucleótidos de largos fragmentos de ácidos nucleicos condujo al desarrollo de procedimientos para determinar la secuencia exacta de nucleótidos de un fragmento dado de ADN o ARN. Los diferentes tipos de métodos de secuenciación están disponibles en la actualidad. Estos métodos de secuenciación, junto con las tecnologías para la construcción de bibliotecas de genomas que representan el genoma completo de un organismo, facilitan la secuenciación de todo el genoma de ese organismo, realizando un análisis en profundidad de las estructuras de genes, funciones de genes, ubicaciones de genes, expresiones de genes, mapeo de genes, regiones reguladoras de genes, etc..

El genoma total de muchos virus, varias bacterias, arqueobacterias, levaduras y algunos otros organismos han sido secuenciados y mapeados. El proyecto del genoma humano ha permitido secuenciar y mapear todo el genoma humano y publicar su primer borrador en 2003. Es un hito importante en el avance de la biología. Las secuencias del genoma humano ahora se utilizan en el sector médico para identificar causas genéticas de enfermedades raras, evaluar el riesgo de enfermedad en recién nacidos, identificar detalles genéticos de diferentes tipos de cáncer, desarrollar nuevas terapias y desarrollar nuevas herramientas de diagnóstico, etc..

En el mundo vegetal, el genoma del arroz y los genomas de Arabidopsis han sido secuenciados. El conocimiento de estas secuencias sin duda revolucionará nuestra comprensión de cómo funcionan las células y los organismos..

Figura_2: Autorradiografía de secuenciación de sanger.

¿Cuál es la diferencia entre la genotipificación y la secuenciación??

Genotipado vs secuenciación
El genotipado es el proceso de determinar la composición genética de un individuo y verificar el grupo o la taxonomía de ese organismo..	La secuenciación es el proceso de determinar el orden preciso de los nucleótidos de un fragmento de ADN o ARN dado.
Tecnicas
RFLP, secuenciación de genes, PCR, microarrays de ADN, AFLP, etc..	Secuenciación de Sanger, secuenciación de Gilbert, pirosecuenciación, secuenciación de próxima generación, secuenciación de escopetas, etc..
Preocupaciones principales
A esto le preocupa más si las diferencias genotípicas están dando las diferencias fenotípicas reales..	Esto está más preocupado por el orden de los nucleótidos y sus diferencias y cambios con otros organismos..

Resumen - Genotipado vs secuenciación

La genotipificación y la secuenciación son útiles para estudiar la información genética de los organismos. La genotipificación es el proceso de determinar las variaciones genotípicas entre individuos y encontrar sus categorías. La secuenciación es el proceso de determinar el orden correcto de los nucleótidos en el fragmento interesado o la región del ADN. Ambas técnicas proporcionan información importante sobre los genes y genomas..

Referencia:
1. "Métodos de genotipado". Métodos en biología molecular (Clifton, N.J.). Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos, n.d. Web. 20 de febrero de 2017.
2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin, y M. D. Shriver. "Análisis de la curva de fusión de los SNP (McSNP): un enfoque sin gel y económico para el genotipado de SNP". BioTechniques 30.2 (2001): 358-67. Web.

Imagen de cortesía:
1. “Genotipado RFLP” por (desconocido) - National Institutes of Health (dominio público) a través de Commons Wikimedia
2. "Fluorescente radioactivo" Por Abizar en Wikipedia en inglés (CC BY-SA 3.0) a través de Commons Wikimedia